在五次元的边缘，一股邪恶的力量，嘉克帝国，威胁着地球的安宁。然而，一道来自地球的光芒挡在了他们的前进路上。那是自古以来守护地球的艾鲁多兰操控的雷神王。然而，在帝国司令官贝路塞夫卑劣的攻击下，雷神王受伤坠落到地球。与此同时，帝国的秘密武器，阿克达玛，也洒落一地。就在这时，阳升学园五年三班正在进行课后自习，雷神王的残影掠过了窗外。艾鲁多兰将雷神金属托付给学生们，并请求他们继续地球的保护。于是，由小学生们组成的「地球防卫组织」应运而生。第二天，阿克达玛释放出恶劣的废气邪兽·艾提索斯。就在这时，学生们手中的雷神金属闪烁着光芒。当白鸟玛丽亚将雷神金属放置在课桌上时，教室竟然转化为了一个指挥中心。而学生们，日向仁、月城飞鸟和星山吼儿，则成为了剑王、凤凰和兽王的驾驶员，勇敢地迎击「嘉克帝国」的邪恶兽。在激战中，小岛勉发现这三台机器人可以合体，最终，三人合而为一，成就了雷神王，成功地击败了邪恶兽。就这样，地球防卫组织的小学生们与邪恶的嘉克帝国展开了一场激烈的对抗……